O Tenente-General Sérgio Pereira, natural de Braga, ingressou na Academia da Força Aérea em 1984.
Após concluir a licenciatura em Ciências Militares Aeronáuticas em 1988 e obter o brevet de piloto, desempenhou diversas funções operacionais, tanto como piloto operacional de helicópteros como de piloto instrutor, principalmente na Esquadra 552 – “Zangões”.
Em 2001, então Major, foi destacado para Timor-Leste, onde comandou o Destacamento de Helicópteros das Nações Unidas (PRT, AUS, NZL, CHL), integrado na Força de Interposição da ONU e na Administração Transitória das Nações Unidas em Timor-Leste. Durante esta missão, realizou mais de 250 horas de voo em operações de inserção e ambientes hostis. Entre 2002 e 2005, já de regresso a Portugal, assumiu o comando da Esquadra 552 e foi nomeado 2º Comandante do Destacamento da Esquadra 201 (F‑16) para as avaliações NATO OPEVAL e OPACCESS.
Entre 2005 e 2009, após concluir o Curso de Estado-Maior Conjunto, no Centro Superior de Estudos da Defesa Nacional, em Espanha, exerceu funções de professor no Instituto de Altos Estudos da Força Aérea, no IAEM, na Escola Superior de Guerra de Angola e, simultaneamente, desempenhou funções de Assessor Militar do Primeiro-Ministro e do Ministério da Defesa Nacional para questões de Defesa Aérea - Renegade. As suas áreas de especialização incluíram Poder Aéreo e Espacial, Planeamento Operacional e Operações Aéreas, sendo autor de vários artigos.
De 2009 a 2012, como Coronel, serviu no NATO Supreme Allied Commander Transformation (SACT), nos Estados Unidos, desempenhando as funções de Deputy Branch Head of the Concept Development and Experimentation Branch, da Capability Development Division.
Entre 2012 e 2017, chefiou a Divisão de Planeamento (J5), no Estado-Maior Conjunto para as Operações Militares do EMGFA, foi Subdiretor da Direção de Ensino da Força Aérea e, entre 2015 e 2017, assumiu as funções de Comandante da Base Aérea n.º 1, em Sintra, até à sua nomeação para o Curso de Oficial General. Após concluir o curso, exerceu funções de Chefe da Divisão de Planeamento da Força Aérea.
Em 2019, promovido a Brigadeiro-General, foi nomeado Diretor de Operações Aéreas do CAOC Torrejón da NATO, onde permaneceu até 2022, ano em que, como Major-General, foi designado Diretor de Pessoal da Força Aérea. Nesse mesmo ano e até janeiro de 2024, desempenhou funções como Chefe do Gabinete do Chefe do Estado-Maior da Força Aérea, até ser promovido a Tenente-General e assumir o cargo de Comandante do Pessoal da Força Aérea, durante um ano, sendo designado Comandante Aéreo em 06 de janeiro de 2025.
Desde 2025, acumula igualmente o cargo de Secretário do Conselho Superior de Defesa Nacional.
Da sua folha de serviço constam vários louvores e condecorações, destacando-se a Ordem de Avis, no grau de Grã-Cruz e de Comendador, várias Medalhas de Serviços Distintos (graus Ouro e Prata), Medalha de Mérito Militar (1º e 2ª classes), Medalha de Mérito Aeronáutico (1ª classe), Medalha de Comportamento Exemplar (graus Ouro e Prata), Cruz Branca de Mérito Aeronáutico da Força Aérea de Espanha e a Medalha das Nações Unidas “In the Service of Peace”.
O Tenente-General Sérgio Pereira é piloto comandante, com mais de 3 600 horas de voo. É casado e tem duas filhas.