Brasão

Escudo - De azul, cruz de vermelho perfilada de prata, carregada com uma vara de Esculápio de ouro, sendo a serpente de verde perfilada de ouro.
Divisa - Num listel de branco, sotoposto ao escudo, em letras de estilo elzevir, maiúsculas, de negro: ««MENS SANA IN CORPORE SANO»».
Coronel Aeronáutico - É de ouro, constituído por um aro liso com virolas nos bordos superior e inferior, encimado por oito pontas, das quais cinco aparentes. A ponta central e as laterais são encimadas por duas asas de águia estendidas. As pontas intermédias são encimadas por cruzes de Cristo.

Simbologia

A Cruz de vermelho - é sinal representativo da atividade desenvolvida pelo Hospital.
A Vara de Esculápio - é símbolo tradicional da medicina.
A Divisa - « SALUS POPULI SUPREMA LEX » exprime a consciência de que o combate contra a dor e contra a morte se sobrepõe a todas as coisas.
Coronel Aeronáutico - é sinal distintivo privativo da Força Aérea que com ele caracteriza todas as suas Unidades e Órgãos.
O azul - significa o zelo e a nobreza traduzida na dedicação.
O verde - simboliza a fé nos próprios recursos enraizada em matura sabedoria.
O vermelho - representa o valor, a coragem e a magnanimidade na luta contra a dor e contra a morte.

Estandarte

Esquartelado de azul e prata com bordadura contra-esquartelada e acantonada dos mesmos, brocante, uma cruz firmada de vermelho.
Ao centro, brocante, sobre o ordenamento e a cruz, o brasão de armas do Hospital circundado por um listel de prata com a divisa «SALUS POPULI SUPREMA LEX».
Nos quatro cantos inscrevem-se as iniciais «HFA» bordadas de prata sobre azul e de azul sobra prata.
O estandarte está debruado por um cordão de prata e vermelho e tem franja de azul e prata.

Brasão de Armas do Diretor

Elmo - de prata, forrado de vermelho e colocado a três quartos para a dextra.
Correia - de vermelho perfilada e afivelada de ouro. 
Paquife e Virol - de ouro, azul e vermelho. 
Timbre - coração de ouro flamejante de azul realçado de prata, carregado de uma cruz de vermelho. 

Simbologia

A Cruz de vermelho - é sinal representativo da atividade desenvolvida pelo Hospital.
A Vara de Esculápio - é símbolo tradicional da medicina.
A Divisa - « SALUS POPULI SUPREMA LEX » exprime a consciência de que o combate contra a dor e contra a morte se sobrepõe a todas as coisas.
O azul - significa o zelo e a nobreza traduzida na dedicação. 
O verde - simboliza a fé nos próprios recursos enraizada em matura sabedoria.
O vermelho - representa o valor, a coragem e a magnanimidade na luta contra a dor e contra a morte.