O Major-General Rafael Martins assumiu o Comando da Academia da Força Aérea, em Sintra, substituindo o Tenente-General Joaquim Borrego, que ocupava o cargo de setembro de 2012.
A cerimónia militar, que se realizou no dia 14 de outubro, foi presidida pelo Chefe do Estado-Maior da Força Aérea (CEMFA), General Manuel Teixeira Rolo, e contou com a apresentação das Forças em Parada, com a integração do Estandarte Nacional na formatura, com alocuções pelo novo Comandante e pelo General CEMFA e, por fim, com o desfile das Forças.
O Major-General Manuel Fernando Rafael Martins é natural de Sardoal, nasceu a 31 de julho de 1961 e tem 35 anos de serviço efetivo. Foi promovido ao posto atual em 17 de dezembro de 2013.
Ingressou na Força Aérea em janeiro de 1979 e na Academia Militar em novembro de 1980, licenciando-se em Ciências Militares Aeronáuticas, na Academia da Força Aérea, em 1985, ano em que concluiu o curso de pilotagem, em Reese AFB, no Texas, nos Estados Unidos da América.
Regressado dos EUA, em 1986, foi colocado na Base Aérea nº 5, em Monte Real, onde permaneceu até 1992.
Após frequentar o Curso Complementar de Aviões de Combate, foi colocado na Esquadra 302, como piloto operacional de A-7P.
Após frequentar o Curso Geral de Guerra Aérea, no ano letivo 1992/1993, foi colocado na Academia da Força Aérea, onde exerceu funções no Gabinete de Estudos e Planeamento e na Direção de Ensino, como docente e Diretor dos cursos de Pilotagem Aeronáutica. Em 1996, regressou à Base Aérea nº. 5, para exercer funções de Comandante da Esquadra 304.
Em 1997, alcançou o grau de Mestre em estratégia no Instituto Superior de Ciências Sociais e Políticas de Lisboa.
Entre 1998 e 2002, esteve colocado em comissão de serviço na NAEW&CF – “Airborne Early Warning and Control System”, em Geilenkirchen, Alemanha, onde desempenhou funções de Piloto Comandante em B-707, tendo participado nas várias Operações da NATO.
Em 2002, assumiu as funções de Chefe da Área de Segurança de Voo, Prevenção e Investigação de Acidentes com aeronaves, na Inspeção Geral da Força Aérea (IGFA), representando Portugal no AFFSC (E).
Em 2006, foi colocado no Instituto de Estudos Superiores Militares (IESM), nas funções de Diretor do Curso de Promoção a Oficial Superior da Força Aérea.
De outubro de 2008 a outubro de 2009, assumiu o Comando da Base Aérea nº 11.
De outubro de 2009 a novembro de 2010, foi Inspetor para a Área de Operações na Inspeção Geral da Força Aérea.
Frequentou o Curso de Promoção a Oficial General no Instituto de Estudos Superiores Militares no ano letivo de 2010/2011.
Foi o Coordenador da Área de Ensino de Operações no Instituto de Estudos Superiores Militares no ano letivo 2011/2012.
Entre 2012 e 2013, exerceu as funções de 2.º Comandante da Academia da Força Aérea e de Diretor do Centro de Estudos Aeronáuticos e do Curso Básico de Comando.
Em 02 de janeiro de 2014, foi empossado nas funções de Subchefe do Estado-Maior da Força Aérea.
Em 14 de outubro de 2016, assumiu o Comando da Academia da Força Aérea.
O Major-General Rafael Martins regista cerca de 3750 horas de voo. Ao longo do seu percurso, foi agraciado com vários louvores e condecorações, destacando-se as Medalhas de Mérito Militar e da Defesa Nacional. Foi ainda agraciado com a Medalha de Mérito Aeronáutico e com duas medalhas alusivas às campanhas aéreas da NATO.
